Monentan ist es so gelöst, dass alle Produkte via Canonical auf die Kategorie-Struktur zeigen, so dass nur diese in den Index wandert. Dies hat natürlich den Nachteil, dass Google die Seiten erstmal crawlen muss, was bei 100.000 x 2 Sprachen schon eine ganze Menge ist. Vorteil ist, dass die Seiten trotzdem eine eigene Struktur via Breadcrumb besitzen, so das der Besucher schnell in den Markenshop zurück findet, aus dem er kommt.
Jetzt bliebe als Alternative die Lösung, dass die Markenshops nur die Adressen enthalten, die auch wirklich im Index sind (sprich die Links mit Kategorien). Zalando macht es glaube ich genau so - vermutlich auch aus besagtem Grund des schnelleren Crawlings.
Was meint Ihr? Besser auf die Navigation verzichten, wenn es um die Crawlbarkeit geht?